5日前に子犬を迎えました。
夜鳴きがひどく、夜通し高い声で甘え鳴きをします。ブリーダーさんは無視を徹底しましょうとアドバイスをくれましたが、全然眠れません。
更に朝見に行くとゲージ内は糞尿まみれでひどい臭いです。
慣れるまで仕方ないのかもしれませんが先が見えません。

寝る時の環境はどういう感じですか
サークルの中にクレートを入れて、ドアを閉めるか
バスタオルなどで覆って落ち着く環境を用意してはどうでしょうか。
うちの子も家に来た当初は夜泣きというか夜暴れというか。中々落ち着いてくれませんでした。
当時はサークルにクレートでした。
なので、サークルからクレートを出し、私のベッドサイド(頭側)におき、犬を入れてドアを閉めることに。
そこから約1年間寝る時はクレートでしたが、吠えることはありませんでした。
2歳になってからはフリーで私と寝ています。
1歳の時にも一度フリーで一緒に寝ましたが落ち着かなかったのでクレートを継続。
バスタオルをかけると声も響かないので試してみてください。夏場はおすすめしませんが、これから寒くなるので、
温かいベッドも入れておくと、やがて落ち着きます。
また、小腹が減って寝れない可能性もあるので
うちでは小鳥用のフック付きの餌入れに少量入れてクレートに取り付けました。

排泄に関しては、寝れないから催してしまうんですよね。
サークル内のトイレは奥側にすると汚れにくいと思います。「出して〜」とピョンピョンするドア付近だと、どうしても踏んづけちゃうので。

また、うちの場合、リビングにもサークルを置いてたんだけど、やはり食事時などに吠えることが多く
思い切ってダイニング側にサークルを移動させたら吠えなくなりました。
寝室もリビングもサークルの場所を(同じ空間内で)変えただけで改善したので、置き場所を再考するのも一つの手段かと。
寝れないと辛いですよね。
せっかく楽しみに迎えた子でしょうから、工夫して乗り切ってくださいね。
一歳半くらいまでは山あり崖ありって感じですが、やがて落ち着いてきますよ