3ヶ月のボーダーコリーなんですがトイレで上手くトイレ出来なくてタイミングよくトイレに連れていくのもなかなかという感じです
しまいにはうんちを踏んでしまい床じゅうべたべたついてしまいます。
犬もまみれになってしまいます
何かいいしつけ方法はないでしょうか？

トイレ環境と、どのようにトレーニングしているのか判らないのですが・・・
一般的に狭いケージに寝床とトイレを置いてトレーニングをします。
覚えの早い犬だと1週間もあればケージ内のトイレが出来るようになります。
ケージの外に出すとそこら中で粗相をします（これが本来の犬で正常な行為です）。

何を間違っているか？
これからケージ内でトイレをさせるトレーニングをするのです。
留守番でもさせるとウンチをする・・・・狭いケージ内を動き回るのだから当然のようにウンコまみれになります。

どうすりゃ、良いのでしょう？
ケージ内でトイレをさせているから、ウンコまみれになっているのですよね。
ケージの外でトイレをさせるとウンコまみれは防ぐ事が出来る。
ウンコしたら即片付ければ解決出来ますよね。
早くトイレトレーニングを完了すれば良いのですよね。

この問題を解決していくと良いのです。

ケージの外に出すとそこら中で粗相をします・・・・これが正常な行為です。
これは？・・・・
寝床周辺でウンチをすると外敵に居場所を知られ狙われるので、寝床周辺でトイレをしないのです・・・・これが犬とか多くの動物の本能で習性です。
だから、寝床から遠〜く離れた場所でトイレをさせるのです（教える）。
犬はテリトリー（寝床・生活エリア）＝縄張り内ではトイレをしないのです。
遠〜くでトイレを教えウンチをすると・・・・ウンコまみれは無いですね。
トイレの場所がケージから離れているので、飼い主さんが犬を誘導してトイレを教える必要が有ります。
犬を誘導してコマンドでトイレをさせる。
飼い主さんの目の前でトイレが出来るので、その場で即片付けが出来ます。ウンコまみれが無い、食糞が出来ないです。

犬が習性に沿った考えのトレーニングのため、犬が嫌がらず早く覚えますよ。

狭いケージに寝床とトイレを置いて、そこでトイレをさせるのは犬の習性を無視したやり方で犬が嫌がります。
狭いケージに寝床を置いて、枕元でウンチをさせて、そこで寝させて、そこで食事をさせて・・・・豚の飼育環境ですよ。
犬が嫌がるから、ご褒美をしこたまやって誉めて褒めまくって、犬の習性を放棄させる洗脳トレーニングです。
簡単にトレーニングか完了すると思えません（焦らず根気よくトレーニングをしましょう、と言うことになる）。

まだ3ヶ月ですよね。うちもその時期はそうでしたよ。子犬は排泄物で汚れるという感覚がまだ無いらしいので。
素人ながらうちの方法ですが
とにかく家にいる時は、チラチラ犬を見てました。いつウンチとおしっこするかな〜と。出来る限り失敗させないのが早く覚えさせるコツです。
ウンチは大体タイミングが決まってます。ご飯の後、何時間たったらなどなど。
オシッコは起きた時と、遊んだ後が多いです。子犬は我慢できないのでオシッコは何回もします。
3ヶ月ならば遊んで20分くらいたったらトイレに連れて行く。掛け声をかける。オシッコするまでケージから出さない。オシッコしたら褒めてまた遊ぶ。それの繰り返ししか無いです。

うちの子はオシッコもウンチもする前にそわそわしてトイレを行ったり来たりします。
床をクンクン嗅ぎますね。

今半年ですがまだ失敗する時もあるしウンチもたまに踏みます。
めげずに頑張って下さい！

サークルはトイレと寝床仕切れるタイプだと踏んだりするのは少なくなるかもです。